Читайте также:
|
|
Одно из важнейших применений закона Харди-Вайнберга состоит в том, что он дает возможность рассчитать некоторые из частот генов и генотипов в том случае, когда не все генотипы могут быть идентифицированы вследствии доминантности некоторых аллелей.
Пример 1: альбинизм у человека обусловлен редким рецессивным геном. Если аллель нормальной пигментации обозначить А, а аллель альбинизма а, то генотип альбиносов будет аа, а генотипы нормально пигментированных людей – АА и Аа. Предположим, что в популяции людей (Европейской части) частота альбиносов составляет 1 на 10000. Согласно закону Харди-Вайнберга, в данной популяции частота гомозигот q2аа=1:10000=0,0001 (0,1%), а частота рецессивных гомозигот =0,01. Частота доминантного аллеля рА=1-qa=1-0,01=0,99. Частота нормально пигментированных людей составляет р2АА=0,992=0,98(98%), а частота гетерозигот 2pqАа=2×0,99×0,1=0,198(1,98%).
Важное следствие из закона Харди-Вайнберга состоит в том, что редкие аллели присутствуют в популяции главным образом в гетерозиготном состоянии. Рассмотрим приведенный пример с альбинизмом (генотип аа). Частота альбиносов равна 0,0001, а гетерозигот Аа 0,00198. Частота рецессивного аллеля у гетерозигот составляет половину частоты гетерозигот, т.е. 0,0099. Следовательно, в гетерозиготном состоянии содержится примерно в 100 раз больше рецессивных аллелей, чем в гомозиготном состоянии. Таким образом, чем ниже частота рецессивного аллеля, тем большая доля этого аллеля присутствует в популяции в гетерозиготном состоянии.
Пример 2: частота фенилкетонурии (ФКУ) в популяции составляет 1:10000, ФКУ – аутосомно-рецессивное заболевание, следовательно индивидуумы с генотипами АА и Аа – здоровы, с генотипами аа – больны ФКУ.
Популяция, следовательно представлена генотипами в следующем соотношении:
p2AA+2pqAa+q2aa=1
??? = 10000.
Исходя их этих условий:
q2aa=1/10000=0,0001.
pA=1-qa=1-0,01=0,99
p2AA=0,992=0,9801
2paAa=2×0,99×0,01=0,0198, или ~1,98% (2%)
Следовательно в данной популяции частота гетерозигот по гену ФКУ по изучаемой популяции составляет приблизительно 2%. Количество индивидумов с генотипом АА составляет 10000×0,9801=9801, количество индивидуумов с генотипом Аа (носителей) составляет 10000×0,0198=198 человек, т.к. относительные доли генотипов в этой популяции представлены соотношением 1(аа):198(Аа):980 (АА).
В том случае, если ген в генофонде представлен несколькими аллелями, например ген I группы крови системы АВ0, то соотношение различных генотипов выражается формулой ( и принцип Харди-Вайнберга остается в силе.
Например: среди Египтян встречаются группы крови в системе АВ0 в следующем процентном соотношении:
0(I) - 27,3%, A(II) - 38,5%, B(III) - 25,5%, AB(IV) - 8,7%
Определить частоту аллелей I0, IA, IB и разных генотипов в этой популяции.
При решении задачи можно воспользоваться формулами:
; (
;
, где А – частота группы крови А (II); 0 – частота группы крови 0(I); В – частота группы крови В(III).
; (
;
Проверка: pIA+qIB+rI0=1 (0,52+0,28+0,20=1).
Для генов, сцепленных с полом, равновесие частоты ХА1ХА1, ХА1ХА2 и ХА2ХА2 совпадают с таковыми для аутосомных генов: p2+2pq +q2. Для самцов (в случае гетерогаметного пола) в силу гемизиготности возможны лишь два генотипа ХА1Y или ХА2Y, которые воспроизводятся с частотой равной частоте соответствующих аллелей у самок в предшествующем поколении: p и q. Из этого следует, что фенотипы, определяемые рецессивными аллелями сцепленных с Х-хромосомой, у самцов встречаются чаще, чем у самок. Так, при частоте аллеля гемофилии qa=0,0001, у мужчин заболевание встречается в 10000 раз чаще, чем у женщин (1/10000млн. у мужчин и 1/100млн. у женщин).
Для установления и подтверждения типа наследования заболеваний необходимо проверить соответствие сегрегации в отягощенных семьях заданной популяции менделеевским закономерностям. Методом c-квадрат подтверждает соответствие количества больных и здоровых сибсов для аутосомной патологии в семьях с полной регистрацией (через больных родителей).
Для расчета сегрегационной частоты можно использовать ряд методов: метод сибсов Вайнберга, пробандовый метод.
Задание 1.
Изучите конспект лекций и материал учебной литературы.
Задание 2.
Запишите в словарь и выучите основные термины и понятия: популяция, панмиксия, панмиксная популяция, генофонд, частота аллеля, частота фенотипа и генотипа в популяции, Закон Харди-Вайнбергера (его содержание), генетическая структура популяции, равновесие генетической структуры популяции в поколениях, мутационное давление, генетический груз, коэффициент отбора, популяционно-генетический анализ, факторы генетической динамики популяции, генетический дрейф, инбридинг, адаптационный коэффициент.
Задание 3.
Смоделируйте панмиксную популяцию и сделайте вывод о ее генетической структуре и о генетическом равновесии в ряду поколений (по заданию преподавателя), в двух вариантах, при s=0 и при s=-1®аа.
Гаметы условно представлены картонными кружочками. Кружок темного цвета обозначает гамету с доминантным аллелем А, белого – с рецессивным аллелем а. Каждая подгруппа получает по два мешочка, в которых по сто «гамет»: в одном – «яйцеклетки», в другом - «сперматозоиды»: например, А – 30 кружочков, а – 70 кружочков, всего – 100 сперматозоидов и также яйцеклеток. Один из студентов достает, не глядя, по одному кружочку («яйцеклетки»), другой аналогично достает кружки –«сперматозоиды», третий студент записывает полученную комбинацию генотипа в Таблицу 5, используя правило конвертов. Сочетание двух темных кружков означает АА, гомозиготу по доминанту; двух белых аа, гомозиготу по рецессиву; темный и белый – Аа, гетерозиготу. Так как сочетание кружков–гамет случайно, то имитируется процесс панмиксии.
Таблица 5. Число генотипов и частота аллелей в модельной популяции
Поколение | Число генотипов | Всего | χ2 | Частота аллелей | |||
АА | Аа | аа | рА | qА | |||
IвариантS=0 F1 F2 F3 | |||||||
![]() | |||||||
IIвариантS=-1®aa F1 F2 F3 F4 F5 F6 |
Во втором варианте следует выполнять работу до тех пор, пока число генотипов не будет повторяться, что свидетельствует об установлении в популяции нового равновесного состояния.
При записи генотипов могут вкрадываться как случайные ошибки, так и отражаться закономерное изменение числа генотипа. Поэтому необходимо вычислить критерий χ2 – критерий соответствия практически полученных данных теоретически ожидаемому.
Для этого определим теоретически ожидаемую частоту генотипов для заданного соотношения гамет. Например, если исходные гаметы: кружки А – 30, а –70; то по таблице Пеннета:
♂ ♀ | pА 0,3 | qа 0,7 |
pА 0,3 | p2AA 0,09 | pqAa 0,21 |
qa 0,7 | pqAa0,21 | q2aa 0,49 |
В этой таблице 0,09 АА – соответствует 9 генотипам АА из 100, 0,42 Аа – соответствует 42 генотипам Аа из 100, 0,49 аа – соответствует 49 генотипам аа из 100 полученных в опыте.
Далее составим таблицу для определения χ2 :
Генотипы | Число генотипов | |||
АА | Аа | Аа | Всего | |
Допустим, практически полученные (P) (в среднем по 3 поколениям) | ||||
Теоретически ожидаемые (q) | ||||
Отклонение (d) | +3 | -6 | +3 | |
χ2факт. = Σd2/q =9:9+36:42+9:49=1 + 0,85 + 0,18 = 2,03; при n' =2, при P =0,05
Сравнив методом χ2 полученные результаты с теоретически ожидаемыми делаем вывод, что в данном случае полученное отношение не отличается от ожидаемого, так как χ2факт. < χ2 табличное 5,99. Следовательно, в I варианте в панмиксной популяции сохраняются первоначальные частоты аллелей (рА – 03 и qa – 0,3). Аналогичную работу проведите для I и II вариантов. Сделайте выводы.
Задание 4.
Решите следующие задачи:
1. Болезнь Тея-Сакса обусловлена аутосомным рецессивным аллелем. Характерные признаки этой болезни – отставание в умственном развитии и слепота, смерть наступает в возрасте около четырех лет. Частота заболевание среди новорожденных около десяти на 1 млн. Исходя из равновесия Харди-Вайнберга, рассчитайте частоты аллелей и гетерозигот.
2. Кистозный фиброз поджелудочной ткани (муковисцидоз) – наследственная болезнь, обусловленная рецессивным аллелем; характеризуется плохим всасыванием в кишечнике и абструктивными изменениями в легких и других органах. Смерть наступает обычно в возрасте около 20 лет. Среди новорожденных кистозный фиброз случается в среднем у 4 на 10000. Исходя из равновесия Харди–Вайнберга, рассчитайте частоты всех трех генотипов у новорожденных, какой процент составляют гетерозиготные носители.
3. Акаталазия – заболевание, вызываемое рецессивным геном, впервые было обнаружено в Японии. У гетерозигот по этому гену наблюдается пониженное содержание каталазы в крови. Частота гетерозигот составляет 0,09% среди население Хиросимы и Нагасаки; и 1,4% среди остального населения Японии. Исходя из равновесия Гарди–Вайнберга, рассчитайте частоты аллелей и генотипов:
- в Хиросиме и Нагасаки;
- среди остального населения Японии.
Задача 4. В таблице приведена частота аллелей, контролирующих группы крови системы АВ0, среди людей из 4 обследованных популяций. Определите частоту различных генотипов в каждой из указанных популяций.
Таблица 6. Частота аллелей, определяющих группы крови АВ0
Популяция | Частота гена | ||
IA | IB | i | |
Индейцы ута | 0,013 | 0,0 | 0,987 |
Эскимосы | 0,333 | 0,027 | 0,640 |
Грузины | 0,198 | 0,038 | 0,764 |
Индийцы | 0,206 | 0,254 | 0,540 |
5. В таблице приведена частота (в процентах) групп крови 0, А, В и АВ в 4 различных популяциях. Определите частоту соответствующих аллелей и разных генотипов в каждой из этих популяций.
Таблица 7. Частота групп крови АВ0
Популяция | Группа крови системы АВ0 | |||
А | В | АВ | ||
Индейцы навахо | 77,7 | 22,3 | ||
Полинезийцы | 36,5 | 60,8 | 2,2 | 0,5 |
Немцы | 36,5 | 42,5 | 14,5 | 6,5 |
Египтяне | 27,3 | 38,5 | 25,5 | 8,7 |
Задание 5.
Ответьте на вопросы для самопроверки:
1. Объясните, что нужно понимать под генетической и генотипической структурой популяции.
2. Какому закону подчиняется генетическая структура популяции, в чем его сущность.
3. Охарактеризуйте факторы динамических процессов в популяции.
4. Коэффициент отбора, его сущность.
5. Почему в близкородственных браках чаще проявляются наследственные заболевания?
6. В каких генотипах содержатся рецессивные аллели в популяциях.
Форма отчета:
- предоставление на проверку рабочей тетради;
- решение задач на определение генетической структуры популяции с использованием Закона Харди-Вайнберга;
- устная защита выполненной работы.
Дата добавления: 2015-01-30; просмотров: 147 | Поможем написать вашу работу | Нарушение авторских прав |