Главная страница | Контакты | Случайная страница Автомобили Астрономия Биология География Дом и сад Другие языки Другое Информатика История Культура Литература Логика Математика Медицина Металлургия Механика Образование Охрана труда Педагогика Политика Право Психология Религия Риторика Социология Спорт Строительство Технология Туризм Физика Философия Финансы Химия Черчение Экология Экономика Электроника

ВВЕДЕНИЕ

ОТЧЕТ

по учебной практике

на тему «Исследование энергетических параметров самоассоциации антиобухолевого антибиотика топотекана»

Выполнил: студент 3 курса, группы Фб-31д

направления подготовки 03.03.02 Физика

(профиль Биохимическая физика)

Паклин Владислав Николаевич

Место прохождения практики: СевГУ

Срок прохождения практики: 29 июня – 26 июля 2015 г.

Руководитель практики ________________ А.А. Мосунов, к.ф.-м.н., доцент

кафедры «Физика»

2015 г.

МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение

высшего образования «Севастопольский государственный университет»

Политехнический институт

Кафедра «Физика»

Направление подготовки 03.03.02 Физика

Профиль Биохимическая физика

УТВЕРЖДАЮ

Заведующий кафедрой«Физика»

________________ М.П. Евстигнеев

“____” ________________ 2015 года

Задание

на учебную практику студенту

ПАКЛИНУ Владиславу Николаевичу

1. Тема работы: Исследование энергетических параметров самоассоциации антиобухолевого антибиотика топотекана.

2. Срок сдачи студентом отчета по практике: 27 июля 2015 г.

3. Исходные данные к работе

Структура молекулы топотекана из PDB-банка данных.

4. Содержание отчета:

1. Расчет парциальных зарядов на атомах молекулы антибиотика.

2. Визуализация проведенных расчетов.

5. Перечень графического материала

_______________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________

6. Консультанты по практике, с указанием относящихся к ним разделов отчета

7. Дата выдачи задания: 29 июня 2015 г.

К А Л Е Н Д А Р Н Ы Й П Л А Н

Студент _____________ В.Н. Паклин

^{(подпись)}

Руководитель _____________ А.А. Мосунов

^{(подпись)}

СОДЕРЖАНИЕ

ВВЕДЕНИЕ. 5

1. БИОФИЗИЧЕСКИЕ И ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ БИОЛОГИЧЕСКОГО ДЕЙСТВИЯ АНТИБИОТИКА ТОПОТЕКАНА И РОДСТВЕННЫХ КАМПТОТЕЦИНОВ.. 6

1.1. Топотекан. 6

1.2. Медико-биологическое значение камптотецинов. 6

1.3. Физико-химические свойства топотекана. 7

1.4. Самоассоциация топотекана. 8

2. ТОПОЛОГИЯ И ПАРАМЕТРИЗАЦИЯ МОЛЕКУЛЫ ТОПОТЕКАНА.. 12

ЗАКЛЮЧЕНИЕ. 16

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ.. 17

Приложение 1. 20

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы. Ароматический антибиотик Топотекан (TPT) – полусинтетеческий аналог природного антибиотика камптотецина. Является одним из перспективных современных препаратов, использующихся при терапии рака. Проявляет свое действие на уровне ДНК топоизомеразы I. Понимание физико-химических особенностей препарата крайне важно для возможности его дальнейшей успешной модификации и выбора наиболее эффективных стратегий терапии. Первым этапом исследования является понимание механизмов, лежащих в основе самоассоциации молекул антибиотика, т.е. их связывания друг с другом. Для описания данного процесса необходимо знать такие параметры, как парциальные заряды на атомах молекулы. Их расчету посвящена данная работа.

Результаты данной работы будут использованы для дальнейших исследований процессов самоассоциации и носят в основном теоретических характер.

Объект исследования – энергетические характеристики механизмов связывания молекул антиопухолевого антибиотика топотекана друг с другом.

Предмет исследования – энергетика самоассоциации топотекана в водной среде.

Цель и задачи исследования. Целью работы является расчет парциальных зарядов на атомах молекул антибиотика топотекана.

Для достижения поставленной цели решалась следующая задача: расчет парциальных зарядов в программе GAUSSIAN 03W различными методами.